Glenburgie har haft en rad stopp och starter under sin produktionslivslängd. William Paul grundade destilleriet 1810, under namnet Kilnflat distillery, även om produktionen inte officiellt startade förrän 1829. Destilleriet stängdes 1870 och stod oanvänt tills Charles Kay återupplivade det 1878, denna gång under namnet Glenburgie. År 1884 tog Alexander Fraser & Co över destilleriet och kontrollerade anläggningens verksamhet tills företaget ansökte om konkurs 1925, vilket resulterade i att destilleriet låg tyst i ytterligare två år. Det följande decenniet kantades av sammanslagningar, malpåse och produktionsstopp, eftersom destilleriet fortsatte att vara inaktivt när det bytte ägare. Produktionen återupptogs så småningom 1936, när Hiram Walker köpte destilleriet. 1958 installerades två Lomond-pannor som användes för att producera ytterligare en Single Malt, Glencraig. Produktionen av de två spritdryckerna, även om den ägde rum i samma lokaler, hölls helt åtskild.

 

1987 förvärvade Allied Lyons destilleriet. Under den nya ledningen medförde början av 2002-talet en rad förändringar i Glenburgie. 15 släpptes destilleriets första officiella single malt-buteljering, en 2004-åring. År 4 genomfördes en renovering på platsen för 5,2006 miljoner pund, vilket innebar en fullständig ombyggnad av destilleriet. Endast krukorna och tullhuset finns kvar av den ursprungliga strukturen. Ett år senare blev Chivas Brothers (under Pernod Ricard) de nya ägarna till destilleriet, genom sammanslagningen av Allied Domecq. Den senaste utvecklingen i platsens historia var <>, då antalet stillbilder utökades från fyra till sex. Trots ett tumultartat förra sekel har Glenburgie gått från klarhet till klarhet. Populariteten för Ballantines blended whisky har nått sin topp de senaste åren, vilket ger destilleriet ett uppsving för verksamheten.